La Direction assure le pilotage du Secrétariat Général (SG), la Direction des utilisateurs et du déploiement (DUD) et la Direction technique (DT).
L'agence est implantée sur un unique site à La Défense afin d'accomplir ses missions au profit de l'ensemble des abonnés du RRF. Elle est organisée autour d'une direction générale, d'un secrétariat général, d'une direction technique, d'une direction des utilisateurs et du déploiement, et d'une direction de l'exploitation :