La Direction assure le pilotage de la Direction de l'exploitation (DE), de la Direction des utilisateurs et du déploiement (DUD), de la Direction technique (DT) et du Secrétariat Général (SG).
La direction générale comprend, outre les directeurs :
- L'agent comptable ;
- L'officier de sécurité ;
- Le correspondant à la protection des données ;
- Le responsable de l'hébergement des données de santé ;
- Le responsable de la communication (espace presse à consulter).